张晓鲁
教授，博导
山东大学齐鲁青年学者，山东省泰山学者青年专家
山东大学基础医学院系统生物医学系副主任（兼）。
【工作经历】
2022年-至今，山东大学基础医学院系统生物医学系副主任（兼）
2020年-至今，山东大学基础医学院生理与病理生理学系副主任（兼），教授，博导
2015年-2019年，瑞典卡罗林斯卡医学院生命科学研究中心（SciLifeLab），博士后
【教育经历】
2011年-2014年，肿瘤学专业，瑞典卡罗林斯卡医学院医学系，博士
2003年-2009年，临床医学专业，山东大学齐鲁医学院，学士
【荣誉奖项】
2020年，入选山东大学齐鲁青年学者
2019年，入选山东省泰山学者青年专家
【研究方向】
张晓鲁教授研究团队主要研究方向为肿瘤克隆进化及异质性。利用整合实验医学生物学和生物信息学手段，通过肿瘤多组学高通量测序技术及数据整合分析技术，结合动物模型解析肿瘤在发生及进展等演进过程中内部肿瘤克隆细胞的进化以及相关分子机制。
【主持科研项目】
1. 基于多组学多因素的胆管细胞癌病理分子分型数学模型的探索及构建（2022.01-2024.12），国家自然科学基金青年项目，课题负责人
2. 早期胃癌多组学特征及肿瘤内异质性研究（2022.01-2024.12），山东省自然科学基金面上项目，课题负责人
3. 从单细胞水平解析KRAS突变逆转微卫星不稳定型结直肠癌免疫敏感性的分子机制研究(2021.11-2024.10)，广东省基础与应用基础研究基金面上项目，课题负责人
4. Tracing the roots of metastasis in breast cancer by multi-regional omics approaches(2016.05-2018.04),瑞典Svenska Sallskapet for Medicinsk Forskning(SSMF)研究基金项目，课题负责人
【主要学术著作】
1. Li H*, Qu L, Yang Y, Zhang H, Li X,Zhang X#. Single-cell transcriptomic architecture unraveling the complexity of tumor heterogeneity in distal cholangiocarcinoma.Cell Mol Gastroenterol Hepatol. 13(5):1592-1609.e9 (2022).
2. Yu J*, Zhang H, Zhang Y,Zhang X#. Integrated analysis of the altered lncRNA, microRNA, and mRNA expression in HBV-positive hepatocellular carcinoma.Life. 12(5):701 (2022).
3. Cheng Y*, Bai F*, Ren X*, Sun R, Guo X, Liu W, Wang B, Yang Y,Zhang X, Xu Y, Li C, Yang X, Gao L, Ma C, Li X, Liang X#. Phosphoinositide-Binding Protein TIPE1 Promotes Alternative Activation of Macrophages and Tumor Progression via PIP3/Akt/TGFβ Axis.Cancer Res. 82(8):1603-1616 (2022).
4. Li H*, Qu L, Zhang H, Liu J.Zhang X#. A comprehensive transcriptomic landscape of cholangiocarcinoma based on bioinformatics analysis from large cohort of patients.Sci Rep. 11(1):13713 (2021)
5.Zhang X*, Garnerone S, Simonetti M, Harbers L, Nicoś M, Mirzazadeh R, Venesio T, Sapino A, Hartman J, Marchiò C, Bienko M, Crosetto N#. CUTseq is a versatile method for preparing multiplexed DNA sequencing libraries from low-input samples.Nature Communications. 10(1): 4732 (2019)
6.Zhang X*, Zhang Q, Dahlström J, Tran AN, Yang B, Gu Z, Ghaderi M, Porwit A, Jia J, Derolf A, Xu D, Björkholm M#. Genomic analysis of the clonal origin and evolution of acute promyelocytic leukemia in a unique patient with a very late (17 years) relapse.Leukemia. 28(8): 1751-4 (2014)
7.Zhang X*, Zeng J*, Zhou M, Li, B, Zhang Y, Huang T, Wang L, Jia J, Chen C#. The tumor suppressive role of miRNA-370 by targeting FoxM1 in acute myeloid leukemia.Mol Cancer. 11: 56 (2012)
8.Zhang X*, Li B*, Yu J, Dahlström J, Tran AN, Björkholm M, Xu D#. MYC-dependent downregulation of telomerase by FLT3 inhibitors is required for their therapeutic efficacy on acute myeloid leukemia.Ann Hematol. 97 (1): 63-72 (2018)
9.Zhang X*, Li, B*, De jonge N, Björkholm M, Xu D#. The DNA methylation inhibitor induces telomere dysfunction and apoptosis of leukemia cells that is attenuated by telomerase over-expression.Oncotarget. 6 (7): 4888-900 (2015)
10. Dahlström J*,Zhang X, Ghaderi M, Hultcrantz M, Björkholm M, Xu D#. Dysregulation of shelterin factors coupled with telomere shortening in Philadelphia chromosome negative myeloproliferative neoplasm.Haematologia. 100 (10): e402-5 (2015)
